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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
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Data corrente: |
29/06/2011 |
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Data da última atualização: |
25/07/2011 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
GARCIA, R. A. V.; RANGEL, P. N.; BRONDANI, C.; MARTINS, W. S.; MELO, L. C.; CARNEIRO, M. S.; BORBA, T. C. O.; BRONDANI, R. P. V. |
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Afiliação: |
ROBERTHA A. V. GARCIA, UNIVERSIDADE FEDERAL DE GOIÁS; PRISCILA NASCIMENTO RANGEL, UNIVERSIDADE FEDERAL DE GOIÁS; CLAUDIO BRONDANI, CNPAF; WELLINGTON S. MARTINS, UNIVERSIDADE FEDERAL DE GOIÁS; LEONARDO CUNHA MELO, CNPAF; MONALISA S. CARNEIRO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE SÃO CARLOS; TEREZA CRISTINA DE OLIVEIRA BORBA, CNPAF; ROSANA PEREIRA VIANELLO BRONDANI, CNPAF. |
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Título: |
The characterization of a new set of EST-derived simple sequence repeat (SSR) markers as a resource for the genetic analysis of Phaseolus vulgaris. |
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Ano de publicação: |
2011 |
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Fonte/Imprenta: |
BMC Genetics, v. 12, n. 41, 2011. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Background: Over recent years, a growing effort has been made to develop microsatellite markers for the genomic analysis of the common bean (Phaseolus vulgaris) to broaden the knowledge of the molecular genetic basis of this species. The availability of large sets of expressed sequence tags (ESTs) in public databases has given rise to an expedient approach for the identification of SSRs (Simple Sequence Repeats), specifically EST-derived SSRs. In the present work, a battery of new microsatellite markers was obtained from a search of the Phaseolus vulgaris EST database. The diversity, degree of transferability and polymorphism of these markers were tested. Results: From 9,583 valid ESTs, 4,764 had microsatellite motifs, from which 377 were used to design primers, and 302 (80.11%) showed good amplification quality. To analyze transferability, a group of 167 SSRs were tested, and the results showed that they were 82% transferable across at least one species. The highest amplification rates were observed between the species from the Phaseolus (63.7%), Vigna (25.9%), Glycine (19.8%), Medicago (10.2%), Dipterix (6%) and Arachis (1.8%) genera. The average PIC (Polymorphism Information Content) varied from 0.53 for genomic SSRs to 0.47 for EST-SSRs, and the average number of alleles per locus was 4 and 3, respectively. Among the 315 newly tested SSRs in the BJ (BAT93 X Jalo EEP558) population, 24% (76) were polymorphic. The integration of these segregant loci into a framework map composed of 123 previously obtained SSR markers yielded a total of 199 segregant loci, of which 182 (91.5%) were mapped to 14 linkage groups, resulting in a map length of 1,157 cM. Conclusions: A total of 302 newly developed EST-SSR markers, showing good amplification quality, are available for the genetic analysis of Phaseolus vulgaris. These markers showed satisfactory rates of transferability, especially between species that have great economic and genomic values. Their diversity was comparable to genomic SSRs, and they were incorporated in the common bean reference genetic map, which constitutes an important contribution to and advance in Phaseolus vulgaris genomic research. MenosBackground: Over recent years, a growing effort has been made to develop microsatellite markers for the genomic analysis of the common bean (Phaseolus vulgaris) to broaden the knowledge of the molecular genetic basis of this species. The availability of large sets of expressed sequence tags (ESTs) in public databases has given rise to an expedient approach for the identification of SSRs (Simple Sequence Repeats), specifically EST-derived SSRs. In the present work, a battery of new microsatellite markers was obtained from a search of the Phaseolus vulgaris EST database. The diversity, degree of transferability and polymorphism of these markers were tested. Results: From 9,583 valid ESTs, 4,764 had microsatellite motifs, from which 377 were used to design primers, and 302 (80.11%) showed good amplification quality. To analyze transferability, a group of 167 SSRs were tested, and the results showed that they were 82% transferable across at least one species. The highest amplification rates were observed between the species from the Phaseolus (63.7%), Vigna (25.9%), Glycine (19.8%), Medicago (10.2%), Dipterix (6%) and Arachis (1.8%) genera. The average PIC (Polymorphism Information Content) varied from 0.53 for genomic SSRs to 0.47 for EST-SSRs, and the average number of alleles per locus was 4 and 3, respectively. Among the 315 newly tested SSRs in the BJ (BAT93 X Jalo EEP558) population, 24% (76) were polymorphic. The integration of these segregant loci into a framework map co... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Análise genética; Microssatélite. |
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Thesagro: |
Feijão; Genética; Marcador molecular; Phaseolus vulgaris. |
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Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/36872/1/bmc.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura; Embrapa Meio-Norte. |
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Data corrente: |
17/12/2009 |
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Data da última atualização: |
13/03/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Folder/Folheto/Cartilha |
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Autoria: |
SOUZA, L. da S.; FUKUDA, W. M. G.; SANTOS, V. da S. (ed.). |
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Afiliação: |
Luciano da Silva Souza, CNPMF; Wânia Maria Gonçalves Fukuda, CNPMF; Chigeru Fukuda Pesquisador aposentado, CNPMF; Carlos Estevão Leite Cardoso, CNPMF; Vanderlei da Silva Santos, CNPMF; Alba Rejane Nunes Farias Pesquisadora aposentada, CNPMF; Joselito da. |
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Título: |
Cultivo, processamento e usos da mandioca para o Estado do Maranhão, com ênfase no Território da cidadania dos Lençóis Maranhenses/Munin: instruções práticas. |
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Ano de publicação: |
2009 |
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Fonte/Imprenta: |
Cruz das Almas: Embrapa Mandioca e Fruticulra Tropical, 2009. |
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Páginas: |
67 p. |
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Descrição Física: |
il. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Importância; Escolha do terreno para plantio; Evite plantar em; Coleta de amostra do terreno para análise; Limpeza do terreno para plantio; Aplicação de calcário; Preparo do terreno para o plantio; Adubação; Escolha das variedades; Seleção das manivas para plantio; Poda; Conservaçãi de manivas; Época de plantio; Espaçamento; Plantio; Controle do mato; Controle da podridão de raízes; Controle das pragas; Ácaros; Percevejo-de-renda; Mosca-branca; Brocas-do-caule; Cupins; Formigas; Colheita; processamento e usos; Farinha d'água; Farinha seca; Farinha mista; Fécula ou goma ou polvilho doce e polvilho azedo; Macaxeira ao natural; Mandioca frita; Beiju; Tapioquinha de goma; Tapioca; Carimã ou massa puba; Tucupi; Sagu; Outros produtos; Tiquira; Folha da mandioca; Farinha de folha da mandioca; Uso integral da mandioca na alimentação animal; Resíduos e subprodutos; Boas práticas de fabricação; Sugestões de melhorias que podem ou devem ser introduzidas nas casas de farinha e nos alabiques de tiquira, tradicionais do Maranhão; Bibliografia consultada. Autores: Luciano da Silva Souza, Wânia Maria Gonçalves Fukuda, Chigeru Fukuda; Carlos Estevão Leite Cardoso; Vanderlei da Silva Santos; Alba Rejane Nunes Farias; Joselito da Slva Motta; José Oscar Lustosa de Oliveira Júnior; Firmino José Vieira Barbosa; Raimundo Bezerra de Araújo Neto; Valdemício Ferreira de Sousa; Pedro Luiz Pires de Mattos; Jayme de Cerqueira Gomes; José Raimundo de Pereira Filho; Marília Ieda da Silveira Folegatti; José Eduardo Borges de Carvalho; Messias Nicodemus da Silva; Carlos Borromeu de Passos Vale; José Antônio Machado; Marney Pascoli Cereda; Mario de Souza Carneiro da Costa. MenosImportância; Escolha do terreno para plantio; Evite plantar em; Coleta de amostra do terreno para análise; Limpeza do terreno para plantio; Aplicação de calcário; Preparo do terreno para o plantio; Adubação; Escolha das variedades; Seleção das manivas para plantio; Poda; Conservaçãi de manivas; Época de plantio; Espaçamento; Plantio; Controle do mato; Controle da podridão de raízes; Controle das pragas; Ácaros; Percevejo-de-renda; Mosca-branca; Brocas-do-caule; Cupins; Formigas; Colheita; processamento e usos; Farinha d'água; Farinha seca; Farinha mista; Fécula ou goma ou polvilho doce e polvilho azedo; Macaxeira ao natural; Mandioca frita; Beiju; Tapioquinha de goma; Tapioca; Carimã ou massa puba; Tucupi; Sagu; Outros produtos; Tiquira; Folha da mandioca; Farinha de folha da mandioca; Uso integral da mandioca na alimentação animal; Resíduos e subprodutos; Boas práticas de fabricação; Sugestões de melhorias que podem ou devem ser introduzidas nas casas de farinha e nos alabiques de tiquira, tradicionais do Maranhão; Bibliografia consultada. Autores: Luciano da Silva Souza, Wânia Maria Gonçalves Fukuda, Chigeru Fukuda; Carlos Estevão Leite Cardoso; Vanderlei da Silva Santos; Alba Rejane Nunes Farias; Joselito da Slva Motta; José Oscar Lustosa de Oliveira Júnior; Firmino José Vieira Barbosa; Raimundo Bezerra de Araújo Neto; Valdemício Ferreira de Sousa; Pedro Luiz Pires de Mattos; Jayme de Cerqueira Gomes; José Raimundo de Pereira Filho; Marília Ieda da Silveira Folegatti; Jos... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Cultivo; Pequeno agricultor. |
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Thesagro: |
Agricultura Familiar; Mandioca. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/143103/1/Cartilha-Maranhao-Cultivo-processamento-e-usos-da-mandioca-para-o-Estado-do-Maranhao.pdf
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Marc: |
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520 $aImportância; Escolha do terreno para plantio; Evite plantar em; Coleta de amostra do terreno para análise; Limpeza do terreno para plantio; Aplicação de calcário; Preparo do terreno para o plantio; Adubação; Escolha das variedades; Seleção das manivas para plantio; Poda; Conservaçãi de manivas; Época de plantio; Espaçamento; Plantio; Controle do mato; Controle da podridão de raízes; Controle das pragas; Ácaros; Percevejo-de-renda; Mosca-branca; Brocas-do-caule; Cupins; Formigas; Colheita; processamento e usos; Farinha d'água; Farinha seca; Farinha mista; Fécula ou goma ou polvilho doce e polvilho azedo; Macaxeira ao natural; Mandioca frita; Beiju; Tapioquinha de goma; Tapioca; Carimã ou massa puba; Tucupi; Sagu; Outros produtos; Tiquira; Folha da mandioca; Farinha de folha da mandioca; Uso integral da mandioca na alimentação animal; Resíduos e subprodutos; Boas práticas de fabricação; Sugestões de melhorias que podem ou devem ser introduzidas nas casas de farinha e nos alabiques de tiquira, tradicionais do Maranhão; Bibliografia consultada. Autores: Luciano da Silva Souza, Wânia Maria Gonçalves Fukuda, Chigeru Fukuda; Carlos Estevão Leite Cardoso; Vanderlei da Silva Santos; Alba Rejane Nunes Farias; Joselito da Slva Motta; José Oscar Lustosa de Oliveira Júnior; Firmino José Vieira Barbosa; Raimundo Bezerra de Araújo Neto; Valdemício Ferreira de Sousa; Pedro Luiz Pires de Mattos; Jayme de Cerqueira Gomes; José Raimundo de Pereira Filho; Marília Ieda da Silveira Folegatti; José Eduardo Borges de Carvalho; Messias Nicodemus da Silva; Carlos Borromeu de Passos Vale; José Antônio Machado; Marney Pascoli Cereda; Mario de Souza Carneiro da Costa.
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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